Sebelum bernama Cokrowati, dulunya desa ini bernama Muncup. Muncup ini adalah kademangan, yang berada di bawah Kawedanan Tambakboyo. Setelah pemerintahan kademangan  dibubarkan, Muncup berubah menjadi desa. Semenjak menjadi desa, berikut ini urutan kepala desa yang memimpin:

1. Sumoastro (Masih bernama Muncup)
2. Pa’e Warinah (Pada tahun 1928 berubah nama menjadi Cokrowati)
3. Galim
4. Suban
5. Kasdo
6. Moroguno
7. Kardjiman
8. Soekengsi Bin Lekidjo (1978 – 1991)
9. Zubaidi Bin Tarub Bin Kasdo (1991 – 2007)
10. Abdul Syukur Bin Muhsin (2007 – 2013 )
11. Karjono Bin Sumirno Bin Tarko (2013 – 2019 )
12. Zubaidi Bin Tarup Bin Kasdo (2019 – 2021)
13. Bambang Hadi Sunarto, S.Sos [Penjabat Kepala Desa] (2021 – 2022)

Sejarah masih dalam proses penulisan ulang